בחודשים האחרונים פעלו בשירות הביטחון הכללי לחקירה ולאיתור המפגעים שביצעו את הפיגוע הקשה במעיין דני.
כבר בראשית החקירה פעלו חוקרי מחוז ש"י וחבלני מג"ב יחד עם שירות הביטחון הכללי לאיסוף ממצאים ראשוניים בזירת הפיגוע.
לוחמי הימ"מ בהכוונת השב"כ ביצעו מספר רב של מעצרים וביניהם מעצרם של חברי החזית העממית שביצעו את הפיגוע.
2 מהמפגעים נעצרו מספר ימים לאחר הפיגוע בפעילות מבצעית של הימ"מ בגזרת רמאללה. הלוחמים פשטו על מספר בתים במקביל תוך סיוע הכלבי איתור ותקיפה שהביאו למעצר המפגעים. המפגע השלישי, שעמד בראש התשתית, הכין והפעיל את המטען, נעצר במהלך חודש ספטמבר בפעילות מורכבת מאוד של הימ"מ ברמאללה תוך הפעלת כוחות גלויים וסמויים. המפגע נעצר במרחב הציבורי רגע לאחר שנהג ברכב ששימש אותו.
לאחר מעצרם וככל שהלכה והתקדמה חקירת שירות הביטחון הכללי ביצעו לוחמי הימ"מ מעצרים נוספים של המעורבים בתשתית הטרור. סרטון מפעילות המעצרים של המפגעים.